根据武士英被捕以后的供述，案情已经很明了，他是通过黑道人物介绍，接了个杀人的差事，报酬为一千现大洋。这个姓陈叫陈玉生的黑道人物将他介绍进了共进会（以青红帮流氓为主要成员的黑社会组织），雇佣他杀人的老板是共进会头目应桂馨。
经过一个多月的审讯后，法租界将武士英引渡给了中国政.府，并将其转移关押到警备森严的上海模范监狱。
可惜，武士英在法祖界关押期间，因受了风寒染病，加之知道自己没有生路后，心理压力太大，加重了病情，于一九一三年四月二十四日病死于监狱内。
为了弄清楚武士英之死，**部门聘请了多位医生对武士英的尸体进行了解剖检验。证明其死于疾病，而非袁世凯方面宣称的被陈其美灭口。
应桂馨的代理律师沃沛辩护道，行凶之人说是某人主使，而没有第三人可以证明，这样的证据是不能够成立的。沃沛虽然没有点出第三人的名字，他所说的第三人显然是指已经于三月二十七日被抓获归案的陈玉生。
令人奇怪的是，已经被抓获归案的陈玉生，一次也没有出现在连续七次的法庭预审当中，而且从此再也没有音讯。
四月十一日下午，公审公堂第六次开庭预审，应桂馨当庭说，三月一日或二日，武士英带着吴乃文的推荐信到他家里求职。他送走武士英后，当即吩咐手下人，以后武士英再来就不要通报接见了，拒不承认买凶杀人的罪行。
案发之后，武士英留在应桂馨家里的吴乃文推荐信被搜查出，保存在巡捕房里。
在宋教仁案的涉案帮凶中，吴乃文是最为关键也最为神秘的一个人。吴乃文既是武士英与应桂馨认识的介绍人，也是在现场指挥武士英刺杀宋教仁的犯罪嫌疑人之一。而在一九一一年十一月九日上海《申报》刊登的《沪军都督府各部职员表》中，谍报科科长应桂馨手下的三名一等科员中，恰好也有吴乃文的名字。
无独有偶，曾经委托王阿发到应桂馨家里登门卖画的拓鲁生，又恰好是为宋教仁送行的国民党要员。
宋教仁案经过会审公廨连续七次的依法预审，遗留下来的最大疑点和盲点，就在于原、被告双方配合默契地避免了武士英与应桂馨的当庭对质。这是一桩并不复杂的暗杀凶案，只要把已经抓捕归案的武士英、应桂馨、陈玉生，以及参与或见证暗杀活动的吴乃文、拓鲁生、王阿发等人拉到一起当庭对质，便可以真相大白。