于是，在王迪的计划书里面，六部就固定下来：吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部。六部的长官很有现代气息的部长。六部之下，设司，每部两司，共计十二司（原时空是每部四司，二十四司），司的长官就是简单明了的司长。为了节约人力成本，六部部长就由内阁的里面的内阁总理以下其余内阁大臣兼任——其实，这等于变相的给李流规定了内阁的人数。
怕李流懵逼，还特意叮嘱他：政权初创的时候，不管怎么平衡怎么制衡，怎么妥协退让，都要把吏部、户部和兵部三个部长人选，或者说相应的内阁大臣，控制在自己这边。王迪相信，就凭自己在后面给李流站台，其他人不会有什么反对意见，而且，只要牢牢把控住这几个部门，也不怕别人有什么反对意见。
如此一来，内阁也就有了尚书省的意思。
门下省，原为皇帝的侍从机构，南北朝时权力逐渐扩大，北朝政出门下，成为中央政权机构的重心。隋唐时与中书省同掌机要，共议国政，并负责审查诏令，签署章奏，有封驳之权。王迪准备令其职能收缩，既然是侍从机构，那就不要做出圈的事情了，专职负责皇帝陛下，孙皓的“儿子”孙文一切起居和安全事务就行了，从国事中剥离出来，如此，也是为了让李流安心一些，感觉少了些掣肘（必要的制衡是要的，但不是通过这一点）。
中书省，曹丕始设，掌管机要、发布政令的机构。隋唐时期成为全国政务中枢。到了宋，中书省与门下省合并为一个机构，曰“中书门下”，掌握行政大权，长官为“同平章事”即宰相，其与掌管军事大权的枢密院合称“二府”。这个部门，被王迪彻底的砍掉了。
其余的乱七八糟的小部门也都被王迪合并同类项，归到了内阁下属的六部里面，而且还告诉李流：六部十二司的人事问题全有他负责，十二司的编制人数也有他负责敲定（初期一定要少，后期可以适量增加，但，够用就行是第一前提），凭借着战场上的武勇，官场上的充分放权，就是要让李流在最短的时间内树立起权威来，这也许不是最好的办法，但，是眼下最合适的办法了。
当然了，还有一环也要做出改变，改组的最后一环。