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抓了张拱宸之后，袁方就去了司礼监向魏忠贤复命，魏忠贤对袁方很是满意，并给了袁方一个新的差事，他让袁方从下个月开始，带领一百名锦衣卫去勖勤宫轮值，为期半年。
魏忠贤特别强调，不可以限制宫里面所有人的出入自由，但必须严密监视宫里每一个人的言行，并及时向魏忠贤禀报。
自从张拱宸被抓之后，震惊了满朝的大臣，东林党官员纷纷出动，上疏劝说朱由校，希望能救下张拱宸。叶向高虽然已经知道抓捕张拱宸的事，他原以为朱由校只是走走过场，所以也出面向朱由校上疏。
而然，令东林党人想不到的是，朱由校坚决不理会东林党的上疏。
叶向高意识到这很可能是魏忠贤在向东林党发起攻击的信号，于是他纠集众御使们再次联合上疏，以皇帝和皇后应当亲厚为由向朱由校施压，结果朱由校反而把犯的并不是死罪的张拱宸等五人用枷号活活虐死。