沈寿在方斯谷和安尼的协助下，只用了一个下午的时间，就把一千水师全部分配在了三百多艘船上，每只船的人员、火器配置全都造册存档，袁方手里也拿到了一份名册。
袁方所率领的这支船队一共有三百零八艘各类船只。
其中有两艘楼船，调拨给袁方使用的楼船不是那种巨型战船，而一款中型二层楼船。
楼船上配置八门千斤佛郎机炮、三个碗口铳、十二门鸟嘴铳，另外有一百个喷筒、一百个烟罐、一千支弩箭、八百斤火药、二百斤火铳药、五百斤各类铅弹、五百支铁箭、三百支火箭、一百块火砖。
另外还配备十二把钩镰枪、十二把大砍刀、二十根过船钉枪、标枪一百五十支、三十面藤牌、一百个灰缸、火绳一百根、铁蒺藜一千个。
在船上还有备用的大小风帆，橹、舵、和缆绳也都有备用的。
作为一船之长的捕盗，还备下了铁钉、油、麻、灰等维修船所用之料。
船上还给每个作战的兵士配备了竹盔一顶、腰刀一把、钉枪一根。
比楼船小一点的是福船，福船有五艘，其火力配置也是很强大的，只是跟楼船比起来稍微逊色了一点。
袁方现在拥有海沧船十二艘，有六艘是李邦华后来调拨的。
苍山船有三十六艘，这种船只能配置二门佛郎机炮，船体比海沧船小，但是操控灵活，速度快。
以上五十五艘船是可以进行海上战斗的，其余的都是补给船和运输船，这些船只主要是运载二千多人所必须的食物、水和武器。
因为袁方这次出海所走的路线都是沿着近海航行，所以苍山船也编入他的船队。
在出发前，袁方订做了一批信号旗，袁方是个穿越者，当然对信号旗是熟悉的，他自己设计图样送去裁缝店，通过巡抚李邦华的关系，包下了天津卫所有的裁缝师傅赶制这批信号旗。
好在信号旗做工简单，加上又是专业的裁缝师傅来承做，这批信号旗三天的时间就全部做完了。
这批信号旗有三种样式，分别是三角旗，方形旗、和燕尾旗，每种旗的颜色有四种，分别是黑色、白色、红色、绿色。
有了信号旗，袁方还要对水师进行信号旗识别训练，由于时间仓促，他只能集中水师中的识字进行训练，起码识字们都认识字，他传授起来也轻松很多。
三样四色就可以有十二种不同样的信号旗，这样就可以代表十二种指令，这是最初级的信号旗使用方法；如果将不同的信号旗进行各种组合，就可以表达出更多的指令，这是中级信号旗的使用方法；如果在把信号旗的数量进行组合，就可以表达宏量的指令，这是高级信号旗的使用方法。
现在袁方只能够制定十二种指令，也就是初级信号旗的使用方法来向识字进行传授，这样他们比较容易理解和接受，在实际的应用中也不容易出错。
首先，袁方让他们有一个感官识别，他把每一种旗所对应的指令写下来，让识字们去背，然后把信号旗插在空地上让他们辨认，这样经过反复的练习，识字们基本能够掌握每种信号旗的含义。
经过两天强化训练，识字们已经完全能够分辨出十二种指令所对应的信号旗了，他们不但可以辨认，而且还把袁方所制定的规则抄录了下来，袁方要求他们不但自己会认信号旗，还要负责教会捕盗――也就是船长，识别信号旗。
由于有李若山的协助，出海的前期工作做的非常的顺利，三月五日这一天，船队便开始出发了。
袁方上了一艘楼船，这艘楼船自然就成为了指挥船，航行在船队的中央，跟随袁方上这艘楼船的有：张从、徐骥、李若山、宋献策、袁二宝、沈智和太监刘荣。
沈寿、郝摇旗、卢象升、方斯谷、安尼、叶向荣等几个上了另一艘楼船，这艘楼船作为主力战舰航行在船队的最前面。
袁方站在二层甲板上，看着楼船徐徐离岸。
在码头的水域中，有三百多只船等待着起航，由于事先做了周密的安排，水面上虽然船只很多，全都井井有序排列着，等待着出港。
水师首领沈寿把船队进行了分组，他把三十艘船分为一组，一组被称为“一纲”，三百艘船分为十纲，每一纲都编了号，设立一名纲长，船队出港就是按照编号，一纲一纲地起航。
甲板上，沈智紧跟在袁方的身边，他提醒袁方道：“宗主，开船了风也大起来了，您回船舱去吧！”
袁方道：“这点风算不了什么，等我们航行到了真正的海上，你就会看到什么是大风大浪。”
此时，张从从船舱里走出来，也劝袁方：“少爷，我们还是回船舱吧，现在船速越来越快，风也越来越大了。”
“我们现在已经离开码头了，这样的船速还不够快。”袁方望了一眼高耸的旗杆，此时旗杆上飘扬的是一面白色三角旗，他对张从道：“传令下去，升起红方旗，全速前进！”
“尊令！”张从转身去传达命令。
袁方看到红旗高高地升起在旗杆上，他才对沈智道：“回船舱。”
红色方形旗表示全速前进之意。
……
袁方的船队出了天津卫，一路向东，绕过山东半岛，然后转向南方。
船队在这一水域航行的过程中十分的安全，途中遇到好几次巡航的水师，这些水师是袁可立派出来的，他们都是沈有容辖下的水师。
途