二亿五千年前，瞳城。
这座末日之城在疯狂的暴力事件中消磨着最后一点能源。每天都有无数的已经放弃生的希望的市民们，就想放纵这余生最后的时光，他们每日酗酒、彻夜狂欢唱歌跳舞，做自己喜欢的荒唐事。
而没有吃的和喝的时候，他们就去抢，向街上的路人抢，从商店里直接抢，如果遇到抵抗，他们不仅抢东西还要砸坏人家的店。
某一天午夜，一群暴徒用撬棍撬开已经关门的商店闯了进去，在里面一顿抢劫。这时住在店面后身的一对夫妻听到声音跑到前面阻止，他们不敢谴责对方，只是不断乞求那些暴徒放过他们。
可是越是恳求，暴徒越是嚣张到不可一世，一位女性暴徒就因为女店主站的位置影响她抢货架上的东西，拎着手中的铁棒照着女店主的头就打了下去。顿时女店头的头血流如注倒在了地上，男店主见状立即扑过来查看妻子的情况，却见妻子已经气若游丝，眼看就活不成了。
男店主立即抱起妻子就向外冲，打算去医院抢救，可是暴徒们此刻也正抢够了东西在向外跑，一个人嫌男店主抱起妻子挡住了门口，竟然直接对着男店主的后心开了一枪。
男店主扑倒在自己的店门口，听到枪声，街口的警报器响了起来，有警察正向这个方向进发，暴徒们踩着男店主的后背，冲出了小商店。
警察是在半个多小时之后才到的，此时的街口只有倒在地上血泊中的夫妻二人，还有一个跪在他们身边痛哭的小男孩儿。
暴徒们早就没了影子，而夫妻二人也早已经断了气，只有小男孩哭得死发生的经过，小男孩儿说，他叫科恩，是夫妻俩的儿子，当午夜他们被撬门时惊醒时，母亲轻轻捂住了小男孩儿的嘴，让他躲在门后的柜子里千万不要出来。
可是小男孩没有听父母的话，在父母出去后，他偷偷地跟在他们身后，扒着后门的门缝向里观看，他把暴徒们所有的罪行都看在眼里，令人吃惊地是他看到父母惨死之时，竟然没有冲动地直接冲出去，而是冷静克制地等在门后。
直到暴徒们全都跑了出去，他才奔到父母的身边，这份克制和冷静确实不像是一个普通的八岁小孩子能够拥有的。
警察问明情况后就把科恩的父母收进了装尸袋带回警局，科恩问道：“你们什么时候能抓住那些杀害我父母的凶手？”
警察叹了一口气，说道：“小孩儿！我劝你这种事还是不要再想了，现在这个社会几乎每个人都是凶手都是暴徒，根本抓不过来的人。你现在最主要的就是想办法保住你自己的命，你若是能平安长大就算是星瞳神保佑了！”
科恩看看警察，突然问道：“那我可以加入你们成为警察吗？”
“嘿！你想干嘛？”
“我想惩罚坏人，保护好人！”科恩语气平静地说道。
警察被他说得心里有些不是滋味，“孩子，不是叔叔不帮你抓坏人，是现在坏人比好人多，比好人狠毒，我们警察已经没有能力保护大家了！”
“那现在什么人有能力可以保护好人呢？”科恩又问出了一个有些意想不到的问题。
“应该是瞳城的管理者长老会吧，必须他们的手中有晶瞳战士！”
科恩：“晶瞳战士很厉害吗？”
“非常非常厉害，坏人们不是他们的对手。”
“那怎么能找到他们，我要找到他们，加入他们，给我父母报仇！”
警察摸摸科恩的头，“现在的晶瞳战士已经沦为长老会的个人军队了，不管百姓疾苦！孩子，你听我说，你现在首要的任务是先活下去，只要活着就有希望。”
“现在瞳城这个样子还有能希望吗？”
“呵呵，谁知道呢！反正不能放弃，因为如果放弃的话，那就是真的没希望了。”
警察走后，科恩关上了店门，拿了一些食物和水，回到后屋把门紧紧关好，如果再来暴徒，他就躲在后屋里不出来。
也许真的是星瞳神保佑，也许警察先生说的对，希望真的出现了，在瞳城的街头出现了一个光头男子带着跛脚的少年。
这二人正是玄和星泽，他们日夜在瞳城的街头巡逻，见到暴徒就是一个字“打”，打到所有人服为止。最终他们两人把瞳城所有的暴徒和混混全部收编，成了他们的小弟，他们禁止暴徒们再去抢劫，而是跟着他们干了一件更逆天的事——冲击长老会。
年少的科恩在听到消息这后便跟在所有人的身后，他亲眼看到星泽是如何把那些晶瞳战士打成烟花绽放的。
后来玄和星泽竟然成功了，他们接手了长老会，把原来的那些腐败官员全部赶走，唯一留下了前城主的女儿婧焱作为主管行政后勤的长老，剩下的全部都是由市民们选举出来的普通人成为了长老和议员。
从此玄成为玄瞳长老，他和新选举的众长老们给末日瞳城带来了新的秩序和希望。随着末日越来越临近，瞳城决定开始把市民们休眠冷冻起来，由计算机灵瞳来监控外界的环境，等到地球的环境适合生存，才根据市民的意愿把他们从沉眠中唤醒。
科恩醒得比星泽要早了三十年，他在这段时间里申请植入晶瞳芯片。为了获得资格，小小年纪的科恩加入了瞳城的采购组，为瞳城采购物资，他在现今社会与瞳城之间游走，看到了很多之前在瞳城所看不到了东西，也多了很多思考。
后来的科恩终于攒够了