陈瀚对大明朝廷是否接受自己挂名归顺很不看好，颇有不悦道：“此等大事以后需得禀明再行处置”
“标下明白”刘庆见主公颇有不满，自己确实有些越权了。
陈瀚看向众将吩咐道：“我们眼下要立即拿下整个东番，澎湖与东番近在咫尺，必须掌握在我们手中，必要时可以将澎湖城的福建水师驱逐。”
卧榻之侧岂容他人鼾睡，何况澎湖之于东番就是一道天然防线，无论如何都必须掌握在自己手中。
“主公英明神武，……”众将纷纷称赞恭贺道：“祝主公武运昌隆”
陈瀚随即吩咐道：“都回营准备吧”
“是”众将纷纷领命出帐
义军开始分兵多路出击攻略东番南部各地，更是深入深山中降服高山中的生番，对负隅顽抗的生番直接镇压俘获带出山中，安置在地势开阔的山间盆地中，由义军军民教授其开垦田地种植粮食农作物，修建房舍居住。
王阿忠率五千义军沿着麻豆番社东部的曾文溪进入位于丘陵河谷中的大武垄盆地（台南玉井区），降服熟番邹族噍吧哖社，随即将百余邹族男子编入义军中作为向导进入东部小淡水上游及北部深山中降服俘获高山生番。
陈阿信率水师第二编队同黄阿有统率的主战营万余大军南下台湾地区，一路南下经过蛟港、魍港、加老湾、鹿耳门，直抵台湾大员港大鲲身潟湖。
义军战船趁着涨潮之际进入大鲲身潟湖，水师营第二编队战船纷纷放下吊板，黄阿有率一万大军冲下战船，直奔大员大鲲身潟湖东边的熟番台窝湾社冲杀而来。
主战营大军将台窝湾社四下合围住，黄阿有朝着身边的向导翻译下令道：“命令台窝湾社番民立即投降”
“是”精通大员熟番语言的汉人翻译接连不断高呼道：“台窝湾社番民听着，义军黄将军命令你们立即投降。……”
没多久，番社中数十名男子在一名正值壮年身形高大赤裸着上身的首领带着前来，朝着黄阿有伏地跪拜高呼道：“大弥勒率台窝湾社番民愿归顺将军”
“很好”黄阿有看向大弥勒吩咐道：“带上你番社中精壮男子随我义军出征，少不了你们的赏赐。”
“是”大弥勒面对兵力众多来势汹汹的义军不敢违抗，只得带着一族男子跟随出征。
黄阿有率军随即向东发起进攻，降服大目降（台南新化区）一带的熟番西拉雅族。
义军水陆并进南下攻略打狗子凤山一带，与木山六郎统率的水师营第一编队及刘雄两千倭人营将士赶来汇合，义军两万余大军席卷整个东番南部地区。
义军接连不断降服沿海一带熟番番社，水师营百余艘适合内河航行的战船沿着小淡水北上阿猴林社（屏东），一举降服位于小淡水东岸的阿猴林社，近万义军将士水陆两路同时出击沿着淡水河北进，与王阿忠部在上游汇合。
五万义军义军军民分散安置在东番北港、台湾、凤山一带开垦田地，修筑城池房舍，当地熟番生番纷纷被打散与义军军民杂居在一起。
整个东番基本上在义军控制之下，魍港一带以林家父子为首的汉番杂居村社都选择臣服义军，唯有澎湖列岛尚在明军福建水师控制之中。
义军主力大军接连不断南下攻略东番南部，沈有容派出的侦缉船不断侦缉到义军水师战船大量南下，整个澎湖水道以东都被义军水师控制。
驻扎在澎湖城的沈有容接连不断收到派出去的侦缉将士返回禀报，有不下三百艘义军大小战船正在南下魍港一带及更南方的台湾大员地区。
沈有容感觉到不妙，对方肯定是想一举控制整个东番，东番岛内究竟是何情况自己手下将士根本不敢登陆查探，沈有容想起那义军将领请自己前往魍港一叙，沈有容当即吩咐道：“传令张彪立即前往魍港再与义军接触，我随后赶到魍港。”
“是”传令兵领命而去
东番魍港，陈瀚统率水陆大军从北港浩浩荡荡南下，义军陆路在双溪口村社驻军，整个魍港地区完全在义军包围之中。
林老爷子派出长子林阿武前往魍港码头恭迎陈瀚大军到来，林阿武看着遮天蔽海的义军战船接憧而至，尤其是那艘高大的舰船足有五六层楼那么高，长不下二十丈，宽七八丈，船型似福船，又不似，既有大弗朗机人战船形状，又有与其相似较大的船帆，更是桅杆林立，足有七桅，战船上还安装有抛石机。
陈瀚得知林老爷子派长子前来恭迎，吩咐秦勇前去将林阿武带上座舰来。
林阿武上到座舰甲板上，看着座舰上没有多少建筑，都是在甲板下，舰上光佛朗机炮就有十几门，甲板上竟铺了一层铁板，就连两侧船舷也包裹有厚铁皮，怕是连炮弹也打不穿。