而且，在得知这艘船沉入海底的时候，明成祖朱棣立刻下了一道圣旨，居然让郑和刚刚回港的船队立刻重新出海，不惜一切代价也要把这艘船捞上来。但就在郑和船队刚刚出港没多久，又接到了朱棣追加的一道圣旨。让所有船队撤回，并且命郑和船队不得将沉船一事散扬出去，违者满门抄斩！
当时船队的人就感到奇怪，只是沉了船而已，并没有什么好奇怪的。就算要封口，也用不着这么狠的惩罚吧？但是碍于圣威，没人敢有异议。这件事便就此压住。有了圣旨封口，郑和宝船沉没一事除了当时港口的少数人和船队的人以外，再无别人知道。
接到了第二道圣旨后，一万多人又稀里糊涂地回来了。但是在船队刚刚靠港的时候，就有数百人被锦衣卫直接带走，而那数百人，正是沉没了主船的船队。当时的郑和，也和前几次归来后的待遇不一样，没有官员迎接，而是在夜间被东厂的太监秘密接走的。
就在郑和回京的当天，立刻就被朱棣召见。进了御书房后，朱棣将侍奉他的太监宫女悉数赶出，只留下郑和密谈。只是当时两人谈的什么，已经没人知道了。而在这次密谈的第二天，明成祖朱棣便再下圣旨，宣布：郑和六下西洋，功德圆满。但此事耗资巨大，恐劳民伤财。所以，下西洋巡游各国之事就此终结。
原本浩浩荡荡，宣耀国威的西洋巡游，只下了六次，便就此终止。直到后来朱棣驾崩后的第七年，即宣德六年，郑和才第七次下西洋。但船队的规模已经远远比不上之前的六次了。
然而，虽然后来再没有下西洋的壮举，可事情却远远没有结束。就在郑和宝船沉没的二十年后，有渔船经过当年宝船覆没的附近海域时，忽然海面腾起大雾，白雾中，船上所有渔夫都看见了一艘巨大的帆船正朝他们驶来。
那帆船出现过于突兀，且两船之间的距离太近。渔船来不及闪避，就被那巨大帆船撞沉。渔船上的渔夫几乎全部葬身海底，只有一个命大的水手，抱着漂浮的木头，在海上飘荡了一天一夜，后遇到途径的商船，这才被救起。
虽然明成祖朱棣曾下过封口令，但那水手在之前就已经得知了郑和宝船沉没一事，而且也见过郑和下西洋的船队主船。认得出来当晚撞沉他们渔船的就是二十年前沉没的郑和宝船。自此，郑和宝船变成幽灵鬼船的传说也就开始了。
而在此之后，每隔二十年左右，就有人在附近海域出现。六百多年的时间反复出现，曾多人见过鬼船的出现，也有不少船被鬼船撞沉，有过不少修行者听闻此事，有心会会这赫赫有名的郑和宝船，但是要么就是运气不好碰不上。碰上的运气更不好，十个有九个留在了海底。
到了民国初期，各地异事局成立起来。管辖内的异事局根据当地的渔民口述，整理相关线索，想要彻底处理幽灵鬼船一事。但是，他们却很悲哀地发现，虽然鬼船曾多次反复出现，却掌握不了具体的出现时间和具体的地点。
只知道鬼船出现必有的一个规律，白雾生，鬼船出。茫霜散，幽魂隐。
也就是说，但凡鬼船出现，海面必生白雾。而在雾散之后，鬼船也随之消失。鬼船每出现一次，传说也变得更为玄乎，有人说，那是地府派来带走海上亡魂的。每次鬼船消失后，就是带着一船的亡魂到地府报道。也有人说，因为郑和出使各国，带回来了不得了的神物。上天不让这神物现世，所以才要覆没了船。
只是传说种种，却始终没有一个官方的说法。幽灵鬼船也成了沿海一带有名的传说……