拓跋思恭见皇上派特使专程下诏，喜形于色，心中思忖：既然皇上这样看得起我，我不能有负皇命。于是，又率八千精骑出征。
宰相王铎见诸道节度使无心征讨起义军，发奋请行。唐僖宗命王铎为中书令、诸道行营都统，诏令夏、绥、鄜、延诸军集结讨贼；授拓跋思恭京城南面收复都统、检校司空同中书门下平章事。受王铎节制。拓跋思恭得诏心中欢喜，率定难军进兵渭桥，与起义军频频交战。
唐僖宗得到战报大喜，进封拓跋思恭为四面收复都统、京兆尹知事。命其随从检校司空、河东节度使李克用调遣。拓跋思恭率定难军连败起义军尚让、黄揆两军，进兵渭南。又与李克用部将杨守宗、白志迁合兵，进攻起义军，一日三捷，起义军败退。官军向京城进兵。
唐中和二年（公元882年）六月，朱温率领三千军马，进攻丹州和延州，又向同州进军。同州刺史米逢弃城逃走，遂占据同州。黄巢封朱温为东南面行营先锋使，同州防御使。朱温再进攻西关，战败诸葛爽，在涑水河破唐将王重荣数千骑。
河中府三十艘军粮船到达夏阳，朱温派遣军兵抢夺。军粮关系到夏阳唐军的生死和军心，王重荣不敢怠慢，亲率唐军三万营救。朱温惧怕，命军兵将粮船凿沉。王重荣见军粮被沉，十分恼怒，遂将朱温人马围困。
朱温被困，派兵向黄巢求救。时任黄巢大齐政权的左仆射兼军容使孟楷，竟将求救文书压下，不向黄巢禀报。朱温非常着急，内无粮草，外无救兵，三千兵马多次厮杀，伤亡减员，已无力对抗唐军。又见黄巢起义军势力消减，形势紧迫。于是，他杀了监军严实，率部投降王重荣。
王重荣非常器重朱温，报以朝廷。唐僖宗大喜，封朱温河中行营诏讨副使、右金吾大将军，并赐名全忠。次年，又封为宣武节度使，命其和沙陀部首领李克用联兵进击黄巢。
黄巢见唐军来势凶猛，于唐中和三年（公元883年）四月再次撤出长安。
诸镇唐军自光泰门进入京城。拓跋思恭率定难军一马当先冲进城，然后表奏朝廷：微臣拓跋思恭收复长安！
躲在蜀地的唐僖宗得到收复都城长安的捷报，大喜过望，跪在祖宗的灵位前，痛哭流涕地禀奏：“苍天有眼，列祖列宗有灵，保我大唐江山永固，万代不衰。我可以回到祖宗打下的长安城了，对得起列祖列宗了。”
黄巢撤出长安后，率军进入商山，沿途抛弃珠宝黄金。唐军不顾将令，争夺财宝。黄巢命孟楷为先锋，进攻蔡州。唐军守将秦宗权战败投降，起义军又进兵围攻陈州。节度使赵犨率军顽强奋战，大小数百战，三百天没有攻下陈州。起义军在华西兵败，孟楷被俘，遭杀害。黄巢撤陈州之围，向汴州挺近，转战山东。
拓跋思恭跟随李克用和朱温追击。唐朝大军追到，黄巢腹背受敌，在王满渡遭到包围，众多将领投降唐军。黄巢屡战失利，退到泰山狼虎谷。后面唐军紧紧追击。
黄巢见无路可走，对外甥林言道：“我欲讨国奸臣，洗涤朝廷，事成不退，亦误矣。你取我的头献于天子，可得富贵，这个好处不要让别人得去了。”
林言跪倒，痛哭着道：“舅舅起义兵，是为穷苦百姓。今虽败，可整军再战。舅舅你快走，外甥掩护。”
黄巢见林言不动手，对着青天高呼：“今生虽败，来生再战！”说完，割喉自刎。
林言见黄巢自杀，抱着舅舅的尸体痛哭，也横剑自杀。唐末农民大起义，在唐军的疯狂征剿中失败。
唐僖宗回到长安，召见拓跋思恭，微笑着对拓跋思恭道：“爱卿果然不负朕所望，救江山社稷于危难之中，平难有功。卿家世居关内道夏州之地，朕就封你为太子太傅、夏国公，夏州、绥州、银州、宥州，全部归爱卿统辖，卿家世守此地，贡职不绝。”
拓跋思恭跪在朝堂上，感激涕零：“微臣谢陛下，吾皇万岁，万岁，万万岁！”
唐僖宗欢喜：“先皇曾经赐爱卿先人拓跋赤辞国姓，朕再次赐你国姓。从今往后，你就不要再姓拓跋了，要姓李。”
拓跋思恭回禀道：“微臣谢陛下国姓的恩赐，我们家族从此不再姓拓跋了，而姓李。微臣也不再叫拓跋思恭了，而是叫李思恭了。”
“好好好，李思恭，好。”唐僖宗大喜，连说了几个好。“爱卿回去以后，好生镇守封地。朝廷如有召唤，爱卿不要推诿。”
李思恭伏在地上立即磕头：“请陛下放心，朝廷如有召唤，微臣一定马不停蹄，肝脑涂地为大唐效犬马之劳。”
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